Rafael Márquez fue como jugador activo uno de los futbolistas más destacados en la historia del balompié mexicano, se desempeñó principalmente como defensa central, aunque también jugó en posiciones de mediocampista defensivo gracias a su gran visión de juego, liderazgo y calidad técnica.
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Jugó en clubes como Atlas (donde debutó), Mónaco, Barcelona (donde ganó múltiples títulos como cuatro Ligas españolas, dos Champions League y un Mundial de Clubes), y regresó a México con León y Atlas.

Con la Selección Mexicana acumuló 148 partidos, 17 goles y participó en múltiples torneos internacionales. Su mayor legado con el Tri está en las Copas del Mundo, donde ostenta récords históricos.
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En cuanto a su mayor aportación a la Selección Mexicana en las Copas del Mundo, destaca su liderazgo constante y consistencia como capitán durante más de una década y media, acompaño al equipo en momentos clave y elevó el nivel competitivo del Tri en la escena mundial.
Aunque México no avanzó más allá de octavos de final en esas ediciones , Márquez fue el pilar defensivo.
Marcó 3 goles en Mundiales y ahora es auxiliar técnico del estratega Javier Aguirre en la Selección Mexicana.